UFO: Extraterrestrials is een turn-based sciencefiction strategiegame dat hetzelfde concept als de voorgaande UFO games volgt. Het spel speelt zich af in het jaar 2025 op de nieuwe gekoloniseerde planeet Esperanza dat wordt aangevallen door aliens. Je krijgt de controle over een groep soldaten, enkele gevechtsvoertuigen, robotten en vliegeenheden op de basis van Esperanza. Als het je lukt om de alieninvasie af te slaan zal het verhaal verder gaan op de planeet Aarde dat ook onder de handen is gevallen van de aliens.

UFO: Extraterrestrials bevat net als de voorgaande delen een zeer geavanceerde kunstmatige intelligentie en bevat enkele nieuwe opties, waaronder de mogelijkheid om gebouwen en muren kapot te schieten en zo een nieuwe weg te creëren. Om nieuwe technologieën te ontwikkelen kun je wetenschappers huren en aan verschillende projecten laten werken. Zo kun je bijvoorbeeld gedode of gevangen aliens onderzoeken, je wapens, bepantsering, granaten, geneesmiddelen, kanonnen, voertuigen, schilden, enzovoorts verbeteren.