Na twee zeer succesvolle delen Splinter Cell kon een derde aflevering niet uitblijven. In dit deel, Chaos Theory genaamd, zijn weer allerlei nieuwe manoeuvres mogelijk en ook de multiplayer-opties zijn flink uitgebreid.
Nieuw is bijvoorbeeld de mogelijkheid om een deur op drie verschillende manieren openen. Je kunt hem normaal open doen, inbeuken of hem stukje voor stukje openen. Tevens is er een nieuwe meter bijgekomen. De meter die aangaf hoe zichtbaar Sam Fischer was, was al kenmerkend voor de serie en nu is er een geluidsmeter aan toegevoegd. Hiermee kan je dus ondervinden wat tegenstanders nou wel en niet horen.
De multiplayer is ook flink uitgebreid. Zowel de coöperatieve als de online modus geven je de mogelijkheid om nóg meer samen te werken dan in Pandora Tomorrow ook al het geval was. Om een hoger gelegen gebied te verkennen kun je iemand bijvoorbeeld een pootje geven. Diegene die dan boven is gooit een touwladder naar beneden om zo ook de tweede man mee te krijgen.